RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF19AQ9NV58 838 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KCND2Q9NZV8 630 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX20Q9UMR3 447 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NOD1Q9Y239 953 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN5AQ14524 2016 aa6.62□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SPINT1O43278 529 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCNE1P24864 410 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB8P26012 769 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMOD1P28289 359 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CTHP32929 405 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2C18P33260 490 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CASP4P49662 377 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DNM2P50570 870 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP2J2P51589 502 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL23P55773 120 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PTENP60484 403 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2BQ00403 316 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAT3Q09327 533 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAAP100Q0VG06 881 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PAK1Q13153 545 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMD2Q13200 908 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TFDP1Q14186 410 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX17Q15036 470 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AMHR2Q16671 573 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SESTD1Q86VW0 696 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM228AQ86W67 206 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM192Q8IY95 271 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP120Q8N960 986 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MLKLQ8NB16 471 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR7Q8TB68 274 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 BICD1Q96G01 975 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD8Q96I13 439 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TIPINQ9BVW5 301 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL16Q9H2A7 254 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCLQ9NW38 375 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.61□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 K7ERI5 159 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN1O60635 241 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CD4P01730 458 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NR3C1P04150 777 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ADRB2P07550 413 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GNAT1P11488 350 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CKBP12277 381 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP1A3P13637 1013 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ADSSP30520 456 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CD52P31358 61 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFSF9P41273 254 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PHKA2P46019 1235 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LIG4P49917 911 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SMTNP53814 917 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 OSTNP61366 133 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG1Q07617 926 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PTK7Q13308 1070 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LPIN1Q14693 890 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 GPNMBQ14956 572 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R5AQ15172 486 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHO2Q8TD55 490 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 ACCSQ96QU6 501 aa6.6□□□□□ -1.35
CAPNS1-208ENST00000589162 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms