RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587167.1

SPHK1-204, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SPHK1, Length 456 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-204ENST00000587167 MCM4P33991 863 aa21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 BMPR1AP36894 532 aa21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 STK4Q13043 487 aa21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 KCNB1Q14721 858 aa21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.41■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.41■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 EPHX3Q9H6B9 360 aa21.41■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.41■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 TOM1L1O75674 476 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 PROZP22891 400 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 ZNF507Q8TCN5 953 aa21.4■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 APOL6Q9BWW8 343 aa21.4■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 CDT1Q9H211 546 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPHK1-204ENST00000587167 HES2Q9Y543 173 aa21.4■■□□□ 1.02
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SPHK1-204ENST00000587167 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.39■■□□□ 1.01
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SPHK1-204ENST00000587167 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPHK1-204ENST00000587167 CEP120Q8N960 986 aa21.36■■□□□ 1.01
SPHK1-204ENST00000587167 CASD1Q96PB1 797 aa21.36■■□□□ 1.01
SPHK1-204ENST00000587167 PLVAPQ9BX97 442 aa21.36■■□□□ 1.01
SPHK1-204ENST00000587167 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.36■■□□□ 1.01
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