RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570385.1

CTDNEP1-203, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-203ENST00000570385 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.53□□□□□ -0.88
CTDNEP1-203ENST00000570385 CLUHO75153 1309 aa9.53□□□□□ -0.88
CTDNEP1-203ENST00000570385 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 EDN1P05305 212 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CLCN5P51795 746 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NTHL1P78549 312 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GRIK3Q13003 919 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 RTP2Q5QGT7 225 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PADI6Q6TGC4 694 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 STAMQ92783 540 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NACC1Q96RE7 527 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NFKBIZQ9BYH8 718 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 FZD8Q9H461 694 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GDAQ9Y2T3 454 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 KRBA1A5PL33 1030 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PTGESO14684 152 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ADAM12O43184 909 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 RECQL4O94761 1208 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 KIF4AO95239 1232 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRKCBP05771 671 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 OR52Z1P0C646 297 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 AOC1P19801 751 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 RFX1P22670 979 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NUBP1P53384 320 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 TUSC3Q13454 348 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NBR1Q14596 966 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ECM1Q16610 540 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 MAPK6Q16659 721 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 LILRA6Q6PI73 481 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 DEPTORQ8TB45 409 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 C8orf76Q96K31 380 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 TUFT1Q9NNX1 390 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 DPP7Q9UHL4 492 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 POLIQ9UNA4 740 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PRR23AA6NEV1 266 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 N4BP3O15049 544 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CCL16O15467 120 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ZMYND10O75800 440 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 THP07101 528 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 LAMP2P13473 410 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CYP11B2P19099 503 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NBL1P41271 181 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PSMD5Q16401 504 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 SPECC1Q5M775 1068 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ERMNQ8TAM6 284 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GPR152Q8TDT2 470 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 TTPALQ9BTX7 342 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 FNIP2Q9P278 1114 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 TRIP11Q15643 1979 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 USP34Q70CQ2 3546 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 I3L4J1 428 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ACKR2O00590 384 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 C8AP07357 584 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 FSHRP23945 695 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 RPA1P27694 616 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NAMPTP43490 491 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 OSTNP61366 133 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 ANGPT1Q15389 498 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 NAB2Q15742 525 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 FAM187BQ17R55 369 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDNEP1-203ENST00000570385 TTC38Q5R3I4 469 aa9.49□□□□□ -0.89
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