RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 CDH7Q9ULB5 785 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 ATRXP46100 2492 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CTDSP2-208ENST00000552294 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ANTXRLA6NF34 631 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MOSPD3O75425 235 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 C8AP07357 584 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ITGA4P13612 1032 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GJA1P17302 382 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SPINK2P20155 84 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SOX9P48436 509 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CLCN6P51797 869 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CDR1P51861 262 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CAPSQ13938 189 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 Q4G0T1 1027 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZS52 159 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 Q6ZUG5 572 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF149Q8NC42 400 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC7A14Q8TBB6 771 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 URGCPQ8TCY9 931 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 OXER1Q8TDS5 423 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BRF1Q92994 677 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC3BQ96PB8 259 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 POLIQ9UNA4 740 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BPTFQ12830 3046 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 IGF2RP11717 2491 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TM4SF5O14894 197 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GIPC1O14908 333 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SEC24AO95486 1093 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 NPTXRO95502 500 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP3A7P24462 503 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 OR1D2P34982 312 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 VIPR2P41587 438 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FNTBP49356 437 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB27AP51159 221 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 JAK3P52333 1124 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PTENP60484 403 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 INF2Q27J81 1249 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FERMT3Q86UX7 667 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CEP57Q86XR8 500 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TTC8Q8TAM2 541 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BSNDQ8WZ55 320 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PGBD4Q96DM1 585 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 DYDC2Q96IM9 177 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CEP170P1Q96L14 293 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BCO2Q9BYV7 579 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 C6orf50Q9HD87 102 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 FNIP2Q9P278 1114 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNJ14Q9UNX9 436 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 K7ESF4 209 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC30A4O14863 429 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SPTLC1O15269 473 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 VNN2O95498 520 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 C1QTNF9P0C862 333 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 GLRA2P23416 452 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 SFNP31947 248 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 BRCC3P46736 316 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PSMC5P62195 406 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP4A11Q02928 519 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-208ENST00000552294 PRKCQQ04759 706 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms