RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 GPR65Q8IYL9 337 aa22.27■■□□□ 1.16
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DDB1-220ENST00000542337 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 28.7
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DDB1-220ENST00000542337 M0R296 226 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 TEX28O15482 410 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 HIP1RO75146 1068 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 NPTX2P47972 431 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 PTPN21Q16825 1174 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.26■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.26■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 CDH22Q9UJ99 828 aa22.26■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 GDAQ9Y2T3 454 aa22.26■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 EFEMP2O95967 443 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 BMP15O95972 392 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 KANK3Q6NY19 840 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.25■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.25■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 USTQ9Y2C2 406 aa22.25■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.24■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.24■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.21■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.21■■□□□ 1.15
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DDB1-220ENST00000542337 PNMA5Q96PV4 448 aa22.21■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.21■■□□□ 1.15
DDB1-220ENST00000542337 SLC16A4O15374 487 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 PLS3P13797 630 aa22.2■■□□□ 1.14
DDB1-220ENST00000542337 GRM5P41594 1212 aa22.2■■□□□ 1.14
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