RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530513.5

PACSIN3-207, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-207ENST00000530513 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.75■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PRR23AA6NEV1 266 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CFHP08603 1231 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 ATP2B1P20020 1258 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 GUCY1B3Q02153 619 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 POTEGQ6S5H5 508 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 MCPH1Q8NEM0 835 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PDZD7Q9H5P4 517 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 TUFT1Q9NNX1 390 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FNIP2Q9P278 1114 aa24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PTGESO14684 152 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 KIF4AO95239 1232 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 EDN1P05305 212 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 TUSC3Q13454 348 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 LILRA6Q6PI73 481 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 GPR65Q8IYL9 337 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FZD8Q9H461 694 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PIDD1Q9HB75 910 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 DCHS1Q96JQ0 3298 aa24.73■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 SPTBN4Q9H254 2564 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 KRBA1A5PL33 1030 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 TADA2AO75478 443 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 NEK4P51957 841 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM187BQ17R55 369 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 SNTG2Q9NY99 539 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 USP20Q9Y2K6 914 aa24.72■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM186AA6NE01 2351 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 RECQL4O94761 1208 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 SEC24BO95487 1268 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 C1RP00736 705 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CREMQ03060 361 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.71■■□□□ 1.55
PACSIN3-207ENST00000530513 N4BP3O15049 544 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ZMYND10O75800 440 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 NAB2Q15742 525 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 NACC1Q96RE7 527 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 WNT16Q9UBV4 365 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 CA14Q9ULX7 337 aa24.7■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 COL4A3Q01955 1670 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 PRKCBP05771 671 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 OR52Z1P0C646 297 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 SRFP11831 508 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 LIG1P18858 919 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ANGPT1Q15389 498 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 PADI6Q6TGC4 694 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 KIFC3Q9BVG8 833 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 MIA3Q5JRA6 1907 aa24.69■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 NOTCH4Q99466 2003 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 LAMP2P13473 410 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 RPA1P27694 616 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 HTR4Q13639 388 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 PSMD5Q16401 504 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 MAPK6Q16659 721 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 TTPALQ9BTX7 342 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 FRYLO94915 3013 aa24.68■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ARHGEF35A5YM69 484 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ADAM12O43184 909 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 THP07101 528 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 CYP11B2P19099 503 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 NAMPTP43490 491 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ZNF174Q15697 407 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 CEP57Q86XR8 500 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 DEPTORQ8TB45 409 aa24.67■■□□□ 1.54
PACSIN3-207ENST00000530513 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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