RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIPOR3Q96MK2 946 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.51■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUTYHQ9UIF7 546 aa18.51■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 C2CD2LO14523 706 aa18.49■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLIN2Q99541 437 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFXN1Q9H9B4 322 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNIP2Q9P278 1114 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NR2E1Q9Y466 385 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFI1A8K8P3 1242 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TEX28O15482 410 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRM5P41594 1212 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.48■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR149Q86SP6 731 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNN1Q92952 543 aa18.47■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.47■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USTQ9Y2C2 406 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0YCG3 227 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCP2P22307 547 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STRN3Q13033 797 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KANK3Q6NY19 840 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RABGGTAQ92696 567 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UROC1Q96N76 676 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCHPQ9BT92 498 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDT1Q9H211 546 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDH22Q9UJ99 828 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIOO75962 3097 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABLIM1O14639 778 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TOM1L1O75674 476 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF4AO95239 1232 aa18.45■□□□□ 0.54
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