RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498213.1

USP54-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-217ENST00000498213 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 OSBP2Q969R2 916 aa5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 TMEM209Q96SK2 561 aa5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 SYT3Q9BQG1 590 aa5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.01□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 FERMT3Q86UX7 667 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 CCDC113Q9H0I3 377 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 KCNH6Q9H252 994 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 ASH2LQ9UBL3 628 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 CROTQ9UKG9 612 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa5□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 MSRB2Q9Y3D2 182 aa5□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 C5orf42Q9H799 3197 aa4.99□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.99□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 DSEQ9UL01 958 aa4.98□□□□□ -1.61
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USP54-217ENST00000498213 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.97□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.97□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 K7ESM1 405 aa4.97□□□□□ -1.61
USP54-217ENST00000498213 FBXO21O94952 628 aa4.97□□□□□ -1.61
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