RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 BICD1Q96G01 975 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 PAGE5Q96GU1 130 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 AAASQ9NRG9 546 aa13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 H0YCG3 227 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 NRP1O14786 923 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 TOM1L1O75674 476 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 GCNT3O95395 438 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 PIGRP01833 764 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 MCF2P10911 925 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 GAP43P17677 238 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 TNFSF9P41273 254 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 GRM5P41594 1212 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 SYKP43405 635 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 LIG4P49917 911 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 DSC1Q08554 894 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 MAP4K3Q8IVH8 894 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 HACE1Q8IYU2 909 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 SPG21Q9NZD8 308 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 SEL1LQ9UBV2 794 aa13.28□□□□□ -0.28
NISCH-210ENST00000488157 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CLDN3O15551 220 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 KLRC4O43908 158 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ZNF202O95125 648 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 HOXD13P35453 343 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 OR1G1P47890 313 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 AMPD3Q01432 767 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 PLCB3Q01970 1234 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 MCL1Q07820 350 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 NAB2Q15742 525 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 TCEAL5Q5H9L2 206 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 MARCH5Q9NX47 278 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 KANSL3Q9P2N6 904 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CITO14578 2027 aa13.27□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 A0A0B4J269 797 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CASTOR2A6NHX0 329 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 FAM189A1O60320 539 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ALDH2P05091 517 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ADSSP30520 456 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SPAG1Q07617 926 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 EHHADHQ08426 723 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 GRIK3Q13003 919 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 PTPROQ16827 1216 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 UNC13DQ70J99 1090 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 IGSF21Q96ID5 467 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ACAP3Q96P50 834 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 MAGEF1Q9HAY2 307 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 COL6A3P12111 3177 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 FSCN2O14926 492 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 THP07101 528 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CXCL8P10145 99 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 ACOT2P49753 483 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 HYAL1Q12794 435 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 XKR4Q5GH76 650 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-210ENST00000488157 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms