RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TAF8Q7Z7C8 310 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 RHPN2Q8IUC4 686 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PCDHGB4Q9UN71 923 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ZHX2Q9Y6X8 837 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 VAV3Q9UKW4 847 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CCDC166P0CW27 439 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 GSTA3Q16772 222 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C12orf60Q5U649 245 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MAPRE3Q9UPY8 281 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 STX5Q13190 355 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM51Q9NW97 253 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TSNQ15631 228 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 B4E1Z4 1266 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C5orf58C9J3I9 102 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 KCNQ4P56696 695 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 NAALADL2Q58DX5 795 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 DENND2AQ9ULE3 1009 aa13.14□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SEMA3DO95025 777 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 XPAP23025 273 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CLEC17AQ6ZS10 378 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 POLNQ7Z5Q5 900 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 AFAP1Q8N556 730 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 UBASH3BQ8TF42 649 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PFDN2Q9UHV9 154 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C2CD2Q9Y426 696 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SNAPC5O75971 98 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 GGA2Q9UJY4 613 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TYSND1Q2T9J0 566 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 FAM162AQ96A26 154 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 INTS13Q9NVM9 706 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 APOL1O14791 398 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM206Q9H813 350 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ASAP1Q9ULH1 1129 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ITGAXP20702 1163 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 WAPLQ7Z5K2 1190 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SETD9Q8NE22 299 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 FAM92AA1XBS5 289 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 GPTP24298 496 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CASP5P51878 434 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TAP1Q03518 808 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MTHFD1LQ6UB35 978 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SPATA4Q8NEY3 305 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 KATNA1O75449 491 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ACLYP53396 1101 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 UGP2Q16851 508 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 RXRAP19793 462 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 DEPTORQ8TB45 409 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.13□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CALN1Q9BXU9 219 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 GPAA1O43292 621 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C6orf10Q5SRN2 563 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 KIAA0408Q6ZU52 694 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 GMFBP60983 142 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ZFP42Q96MM3 310 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MATN2O00339 956 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 TFDP2Q14188 446 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 HDHD2Q9H0R4 259 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 JAK2O60674 1132 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 NT5C2P49902 561 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 NDUFAF2Q8N183 169 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.12□□□□□ -0.31
SOGA3-207ENST00000481848 MED10Q9BTT4 135 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms