RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 MAGEA9P43362 315 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PSMC5P62195 406 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 LONRF3Q496Y0 759 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 C8orf34Q49A92 452 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 WASF1Q92558 559 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 DDX12PQ92771 950 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SHDQ96IW2 340 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 NLRP4Q96MN2 994 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 CACNA1BQ00975 2339 aa8.54□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 C2CD2LO14523 706 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SPTLC1O15269 473 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 TGM5O43548 720 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 CHMP2AO43633 222 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 KINO60870 393 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 LILRB5O75023 590 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 POU2F2P09086 479 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 AK2P54819 239 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PRKCQQ04759 706 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 POU5F1BQ06416 359 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SCRN1Q12765 414 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PPP2R5CQ13362 524 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 DCLK2Q8N568 766 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 TBCKQ8TEA7 893 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 PHKBQ93100 1093 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 GTF3C6Q969F1 213 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 GJA10Q969M2 543 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC51Q96ER9 411 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 MIOSQ9NXC5 875 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.53□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 VWA8A3KMH1 1905 aa8.52□□□□□ -1.04
RBBP4-211ENST00000477563 LAMA1P25391 3075 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 ARL5CA6NH57 179 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 ZMYND10O75800 440 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 ITGA4P13612 1032 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 HOXA9P31269 272 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 RFC5P40937 340 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 OR1G1P47890 313 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 GPC5P78333 572 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 CREMQ03060 361 aa8.52□□□□□ -1.05
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RBBP4-211ENST00000477563 PROX2Q3B8N5 592 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 USP41Q3LFD5 358 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 SPECC1Q5M775 1068 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 C4orf19Q8IY42 314 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 TCP11Q8WWU5 503 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 FGF14Q92915 247 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 EPC1Q9H2F5 836 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 TPCN1Q9ULQ1 816 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 IPPQ9Y573 584 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.52□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 ACACBO00763 2458 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 COL4A3Q01955 1670 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 EML1O00423 815 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 TSPAN1O60635 241 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 LRRN2O75325 713 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 NR1I2O75469 434 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 TDP2O95551 362 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RBBP4-211ENST00000477563 RFX1P22670 979 aa8.51□□□□□ -1.05
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