RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.93■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.93■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.93■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.93■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 PRR33A8MZF0 331 aa22.92■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 USP41Q3LFD5 358 aa22.92■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 TADA2AO75478 443 aa22.91■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 SYT1P21579 422 aa22.91■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 GRM5P41594 1212 aa22.91■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.91■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 FNIP2Q9P278 1114 aa22.91■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 NR2E1Q9Y466 385 aa22.91■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 COL9A1P20849 921 aa22.9■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 PROZP22891 400 aa22.9■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 XKR4Q5GH76 650 aa22.9■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.9■■□□□ 1.26
SIKE1-204ENST00000462123 ZPBP2Q6X784 338 aa22.9■■□□□ 1.26
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SIKE1-204ENST00000462123 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.89■■□□□ 1.25
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SIKE1-204ENST00000462123 USTQ9Y2C2 406 aa22.89■■□□□ 1.25
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SIKE1-204ENST00000462123 TOM1L1O75674 476 aa22.88■■□□□ 1.25
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SIKE1-204ENST00000462123 PTPAQ15257 358 aa22.88■■□□□ 1.25
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SIKE1-204ENST00000462123 PDXDC1Q6P996 788 aa22.88■■□□□ 1.25
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SIKE1-204ENST00000462123 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.87■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.87■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 GDAQ9Y2T3 454 aa22.87■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 ABLIM1O14639 778 aa22.86■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 GLUD1P00367 558 aa22.86■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 DDIT3P35638 169 aa22.86■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF131P52739 623 aa22.86■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 NCKAP1LP55160 1127 aa22.86■■□□□ 1.25
SIKE1-204ENST00000462123 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
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