RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 CPLX1O14810 134 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 TSPAN1O60635 241 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 TADA2AO75478 443 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 PTENP60484 403 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 POU5F1BQ06416 359 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 C4orf19Q8IY42 314 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 NELL2Q99435 816 aa21.58■■□□□ 1.05
LTB-210ENST00000429299 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 M0R2N6 131 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 EMC2Q15006 297 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 BLIDQ8IZY5 108 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 FGF13Q92913 245 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 KIF2CQ99661 725 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 VAV3Q9UKW4 847 aa21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CDKL5O76039 1030 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 HOXA9P31269 272 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LMNB2Q03252 620 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LIN9Q5TKA1 542 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 GALNT17Q6IS24 598 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 NELL1Q92832 810 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CPB2Q96IY4 423 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 APOL6Q9BWW8 343 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.56■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 NCAM2O15394 837 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 GRIK3Q13003 919 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 STK3Q13188 491 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TFDP1Q14186 410 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CLDN23Q96B33 292 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MTRQ99707 1265 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 EPC1Q9H2F5 836 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 SLC37A4O43826 429 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TBC1D4O60343 1298 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PFKFB2O60825 505 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LILRB5O75023 590 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 XYLBO75191 536 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 AKAP5P24588 427 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 NTHL1P78549 312 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 EPHA7Q15375 998 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 XKR9Q5GH70 373 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 RTP2Q5QGT7 225 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 TTPALQ9BTX7 342 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.54■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 C8AP07357 584 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 AMHR2Q16671 573 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 INF2Q27J81 1249 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 UVSSAQ2YD98 709 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 RABGGTAQ92696 567 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 LXNQ9BS40 222 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 RTKNQ9BST9 563 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 F5P12259 2224 aa21.52■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 POU2F2P09086 479 aa21.52■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 CD72P21854 359 aa21.52■■□□□ 1.04
LTB-210ENST00000429299 MCM2P49736 904 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms