RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 RSAD1Q9HA92 442 aa9.76□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.76□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.76□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 EVPLQ92817 2033 aa9.76□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 HRO43593 1189 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MGEA5O60502 916 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 RFX1P22670 979 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SYKP43405 635 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 RABGGTBP53611 331 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MAPK7Q13164 816 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 EPC2Q52LR7 807 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SHC4Q6S5L8 630 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 KCNK18Q7Z418 384 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 RETREG3Q86VR2 466 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 DAW1Q8N136 415 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TIGD1Q96MW7 591 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 UROC1Q96N76 676 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF558Q96NG5 402 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 REEP2Q9BRK0 252 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TCHPQ9BT92 498 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 DPP7Q9UHL4 492 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TBX20Q9UMR3 447 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 IPPQ9Y573 584 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 UBE4BO95155 1302 aa9.75□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GRXCR1A8MXD5 290 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 LPXNO60711 386 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 OFD1O75665 1012 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 FOSL2P15408 326 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PPP1R2P41236 205 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GRM5P41594 1212 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CREMQ03060 361 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GRIN1Q05586 938 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GRIK3Q13003 919 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PKP1Q13835 747 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 AAK1Q2M2I8 961 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PDXDC1Q6P996 788 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CASD1Q96PB1 797 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 ACCSQ96QU6 501 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PLIN2Q99541 437 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TRIM9Q9C026 710 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PANK4Q9NVE7 773 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SPG21Q9NZD8 308 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 COG5Q9UP83 839 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TET1Q8NFU7 2136 aa9.74□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SCN5AQ14524 2016 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 K7ENM7 598 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC16A4O15374 487 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TRAPPC3O43617 180 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 THP07101 528 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CLTAP09496 248 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 IDEP14735 1019 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 PROZP22891 400 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 CTNNB1P35222 781 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 LIG4P49917 911 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 MCL1Q07820 350 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 GPM6BQ13491 265 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 TCTN1Q2MV58 587 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 SPECC1Q5M775 1068 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 UBXN11Q5T124 520 aa9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms