RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 CXorf38Q8TB03 319 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 Q8TCH9 128 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RELTQ969Z4 430 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 TMEM140Q9NV12 185 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-211ENST00000426951 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DTNBO60941 627 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ZNF623O75123 536 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GPR32O75388 356 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 COMTP21964 271 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PCSK1P29120 753 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GUCY1A2P33402 732 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MLC1Q15049 377 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PPP4R3AQ6IN85 833 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 POLNQ7Z5Q5 900 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RSPH3Q86UC2 560 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PRR18Q8N4B5 295 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MB21D1Q8N884 522 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TMX3Q96JJ7 454 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 K7ESM1 405 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MARCH6O60337 910 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 OFD1O75665 1012 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 RAP2AP10114 183 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 IL2RBP14784 551 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GNAT2P19087 354 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DDCP20711 480 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ALDH1A3P47895 512 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FLT3LGP49771 235 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CDC42EP1Q00587 391 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HHEXQ03014 270 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FAM47AQ5JRC9 791 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 AFMIDQ63HM1 303 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ANKS6Q68DC2 871 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MFSD5Q6N075 450 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 C14orf80Q86SX3 495 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DRC7Q8IY82 874 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DNERQ8NFT8 737 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SLC35B2Q8TB61 432 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HPS3Q969F9 1004 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 BORCS6Q96GS4 357 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 AIFM3Q96NN9 605 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MAP3K14Q99558 947 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 KCNH6Q9H252 994 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DEF6Q9H4E7 631 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HDAC5Q9UQL6 1122 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CAPN14A8MX76 684 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MFAP3LO75121 409 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 HSPA6P17066 643 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 DSC2Q02487 901 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SP140Q13342 867 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MTM1Q13496 603 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 GTF2H3Q13889 308 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 PGS1Q32NB8 556 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 TTC7BQ86TV6 843 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 FAM83AQ86UY5 434 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MAGEB6Q8N7X4 407 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CHST13Q8NET6 341 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 ST8SIA2Q92186 375 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MVB12AQ96EY5 273 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 SAMD11Q96NU1 681 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 MYOCQ99972 504 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-211ENST00000426951 CD248Q9HCU0 757 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms