RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 RRM2BQ7LG56 351 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA17Q96L03 361 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EGFL8Q99944 293 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFATQ9P243 1243 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MEGF6O75095 1541 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH16O75309 829 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAPQ13588 217 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HIC1Q14526 733 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA21Q7Z572 469 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 THEM5Q8N1Q8 247 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 THAP11Q96EK4 314 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 COG4Q9H9E3 785 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO40Q9UH90 709 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CPDO75976 1380 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PAPPAQ13219 1627 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L5A8MUK1 530 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 E5RI56 91 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3R2O00459 728 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDX5P30044 214 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP2Q15833 593 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR24Q96S15 920 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX12Q9UMY4 172 aa11.63□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 H0Y626 953 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 M0QYV0 167 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM16O95361 564 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM49P0CI25 452 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM49CP0CI26 452 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2D6P10635 497 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA2P16389 499 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ROR1Q01973 937 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HIF1AQ16665 826 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EFHC2Q5JST6 749 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TAGAPQ8N103 731 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF17Q9P2E2 1029 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF711Q9Y462 761 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEFA5A3E0 1075 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF197O14709 1029 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEIP0CG38 1075 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH6P55285 790 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AP1B1Q10567 949 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEGQ6S5H5 508 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 BEST2Q8NFU1 509 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CSPG5O95196 566 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR29P0C7W0 189 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MYBL1P10243 752 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC1P48995 793 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PID1Q7Z2X4 250 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ATL2Q8NHH9 583 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ERBB3P21860 1342 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NEMP1O14524 444 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ARSEP51690 589 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY1Q01534 308 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL3Q13618 768 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RFX8Q6ZV50 586 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF135Q8IUD6 432 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SPON2Q9BUD6 331 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TRABDQ9H4I3 376 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AGTP01019 485 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNA4P22459 653 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SFNP31947 248 aa11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MDH1P40925 334 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms