RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 WNT16Q9UBV4 365 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 POLIQ9UNA4 740 aa21.4■■□□□ 1.02
UBXN4-202ENST00000415164 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 17.2
UBXN4-202ENST00000415164 WNT7AO00755 349 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 LARGE1O95461 756 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 EFEMP2O95967 443 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 SRFP11831 508 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 RTP2Q5QGT7 225 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FNIP2Q9P278 1114 aa21.39■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1B0GUA9 196 aa21.38■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 FSHRP23945 695 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TUSC3Q13454 348 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 LIN9Q5TKA1 542 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 SNTG2Q9NY99 539 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 NUMBLQ9Y6R0 609 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.38■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 JAK2O60674 1132 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYND10O75800 440 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 KIF4AO95239 1232 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 LAMP2P13473 410 aa21.37■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 NTHL1P78549 312 aa21.37■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 ME3Q16798 604 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 GTF3C6Q969F1 213 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 NXPE3Q969Y0 559 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TTPALQ9BTX7 342 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 USP20Q9Y2K6 914 aa21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 N4BP3O15049 544 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 GUCY1B3Q02153 619 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PPM1LQ5SGD2 360 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 LILRA6Q6PI73 481 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 GDAQ9Y2T3 454 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 R4GN57 208 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TTLL13PA6NNM8 815 aa21.35■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 MTMR9Q96QG7 549 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 HINFPQ9BQA5 517 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.35■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 MED24O75448 989 aa21.34■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 C8AP07357 584 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ID4P47928 161 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 MAPK6Q16659 721 aa21.34■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.34■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 PTGESO14684 152 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
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UBXN4-202ENST00000415164 PARM1Q6UWI2 310 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ERMNQ8TAM6 284 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 BSNDQ8WZ55 320 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 NACC1Q96RE7 527 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FOXQ1Q9C009 403 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 FZD8Q9H461 694 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 POLD4Q9HCU8 107 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.33■■□□□ 1.01
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.33■■□□□ 1
UBXN4-202ENST00000415164 C1RP00736 705 aa21.32■■□□□ 1
UBXN4-202ENST00000415164 ANAPC15P60006 121 aa21.32■■□□□ 1
UBXN4-202ENST00000415164 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.32■■□□□ 1
UBXN4-202ENST00000415164 GPR65Q8IYL9 337 aa21.32■■□□□ 1
UBXN4-202ENST00000415164 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.32■■□□□ 1
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