RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389398.9

VWA3A-202, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene VWA3A, Length 4,600 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-202ENST00000389398 TP53BP2Q13625 1128 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CITED4Q96RK1 184 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 WDR64B1ANS9 1081 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 VWA5AO00534 786 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCNE1P24864 410 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RAB15P59190 212 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LLGL1Q15334 1064 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC182A6NF36 153 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A8MXQ7 604 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 USP1O94782 785 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ITGA9Q13797 1035 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CALCRLQ16602 461 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SIRT1Q96EB6 747 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CEP95Q96GE4 821 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CNPY3Q9BT09 278 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RRAGCQ9HB90 399 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KRT84Q9NSB2 600 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NOS1P29475 1434 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A0A1W2PRG6 482 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 IST1P53990 364 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PTK2Q05397 1052 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LGALS3BPQ08380 585 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NR1D2Q14995 579 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 PI16Q6UXB8 463 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 BORCS5Q969J3 196 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 NDST4Q9H3R1 872 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 A0A087WXM4 84 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ASAP2O43150 1006 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MXI1P50539 228 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SCNN1BP51168 640 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RFX6Q8HWS3 928 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TAGAPQ8N103 731 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LINS1Q8NG48 757 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 VPS39Q96JC1 886 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 TINF2Q9BSI4 451 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RUBCNLQ9H714 662 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.41□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 LGALS16A8MUM7 142 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 ATP6V1C1P21283 382 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DGUOKQ16854 277 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 MICALL2Q8IY33 904 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 AGAP11Q8TF27 550 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 RMDN1Q96DB5 314 aa8.4□□□□□ -1.06
VWA3A-202ENST00000389398 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms