RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379359.3

RGCC-201, Transcript of regulator of cell cycle, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RGCC, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGCC-201ENST00000379359 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CALML4Q96GE6 196 aa22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TIPINQ9BVW5 301 aa22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SFI1A8K8P3 1242 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 UBA7P41226 1012 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CLCN4P51793 760 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 USP41Q3LFD5 358 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KANK3Q6NY19 840 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 HASPINQ8TF76 798 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 B3GALT6Q96L58 329 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 PNMA5Q96PV4 448 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TCHPQ9BT92 498 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 POMKQ9H5K3 350 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CACNG4Q9UBN1 327 aa22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SLC16A4O15374 487 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 PLA2G4BP0C869 781 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SMTNP53814 917 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 YARSP54577 528 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 STRN3Q13033 797 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 HYIQ5T013 277 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 DAW1Q8N136 415 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 AK8Q96MA6 479 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TMEM134Q9H6X4 195 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 DPP7Q9UHL4 492 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.99■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 128.5
RGCC-201ENST00000379359 PTGESO14684 152 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TEX28O15482 410 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 LILRB3O75022 631 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 GLUD1P00367 558 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 GUCY2CP25092 1073 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 DSG1Q02413 1049 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CUL4AQ13619 759 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 EDAQ92838 391 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.98■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 MYBP10242 640 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 OSTNP61366 133 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 MAPK7Q13164 816 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CEP57Q86XR8 500 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 BACH2Q9BYV9 841 aa21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 PLS3P13797 630 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CREMQ03060 361 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 PALB2Q86YC2 1186 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CDT1Q9H211 546 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 CHST7Q9NS84 486 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 KCND2Q9NZV8 630 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.96■■□□□ 1.11
RGCC-201ENST00000379359 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 SLC26A4O43511 780 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 KIF4AO95239 1232 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 SLC12A3P55017 1021 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 ZXDAP98168 799 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 GPBP1Q86WP2 473 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.95■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 EFEMP2O95967 443 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 SPATA31D3P0C874 917 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 GRM5P41594 1212 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 PTPN21Q16825 1174 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.94■■□□□ 1.1
RGCC-201ENST00000379359 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms