RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320122.10

LMO3-202, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-202ENST00000320122 SCINQ9Y6U3 715 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SNED1Q8TER0 1413 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ASTN1O14525 1302 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TTC36A6NLP5 189 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RASA4BC9J798 803 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FSCN2O14926 492 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RASA4O43374 803 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IL1R1P14778 569 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KRT15P19012 456 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 YY1P25490 414 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VAMP7P51809 220 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZBTB16Q05516 673 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IRGCQ6NXR0 463 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MCUR1Q96AQ8 359 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NUP85Q9BW27 656 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CPVLQ9H3G5 476 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RPTORQ8N122 1335 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SMIM24O75264 130 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ACSL3O95573 720 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MARK3P27448 753 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GTF2H1P32780 548 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ITPK1Q13572 414 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RELL1Q8IUW5 271 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 STK32AQ8WU08 396 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 C18orf8Q96DM3 657 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 BACH1O14867 736 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PSTPIP1O43586 416 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CCDC22O60826 627 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SHBGP04278 402 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CYP1A2P05177 515 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ATP6V1C1P21283 382 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VHLP40337 213 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RAD23BP54727 409 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PTP4A2Q12974 167 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RASA2Q15283 850 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PTPROQ16827 1216 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 ARSHQ5FYA8 562 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 KRT39Q6A163 491 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SESTD1Q86VW0 696 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TDRPQ86YL5 185 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TPH2Q8IWU9 490 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 VPS52Q8N1B4 723 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 COA1Q9GZY4 146 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PDP2Q9P2J9 529 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 USP17L10C9JJH3 530 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 K7ENM7 598 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 AKR1B1P15121 316 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TSHRP16473 764 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PAX7P23759 505 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PTPN4P29074 926 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 RFC4P35249 363 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PEX19P40855 299 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GRIK3Q13003 919 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 GRM1Q13255 1194 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 PICALMQ13492 652 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 CCNG2Q16589 344 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 WDR44Q5JSH3 913 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 LGSNQ5TDP6 509 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-202ENST00000320122 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms