RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 GIT2Q14161 759 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 VPS16Q9H269 839 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PARVGQ9HBI0 331 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 TXLNGQ9NUQ3 528 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MAGEC1O60732 1142 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 TMCC1O94876 653 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 INPP1P49441 399 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 SLC26A2P50443 739 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 C1QTNF8P60827 252 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PPP2R5CQ13362 524 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 C16orf87Q6PH81 154 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 IFT43Q96FT9 208 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.31□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 DYTNA2CJ06 578 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 TMEM247A6NEH6 219 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 UNCXA6NJT0 531 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 GAKO14976 1311 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 DYRK3O43781 588 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 NMT2O60551 498 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 NEDD4P46934 1319 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 LMNB2Q03252 620 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ARL8AQ96BM9 186 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CCDC51Q96ER9 411 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CDC23Q9UJX2 597 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 C2CD2LO14523 706 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 IFNA8P32881 189 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ATP6V1E1P36543 226 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CAP2P40123 477 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 NECTIN1Q15223 517 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MTA3Q9BTC8 594 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ADCY1Q08828 1119 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 NFIAQ12857 509 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 EPC1Q9H2F5 836 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MYL4P12829 197 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FOSL2P15408 326 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 STAT1P42224 750 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 MAGEA1P43355 309 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 COLEC12Q5KU26 742 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 SP110Q9HB58 689 aa8.3□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 CHGBP05060 677 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 LAG3P18627 525 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 SOX5P35711 763 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 RPS6KA1Q15418 735 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 STILQ15468 1287 aa8.29□□□□□ -1.08
USP3-201ENST00000268049 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms