RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pramef12Q9D2F1 463 aa13.59□□□□□ -0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D2Q3 444 aa13.59□□□□□ -0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbpl9A2A8Z1 736 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 R3hdm1E9Q9Q2 1135 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4841E9QAA8 417 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21973F6WEZ7 68 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna2d1O08532 1103 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr1i3O35627 358 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pja1O55176 578 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CraddO88843 199 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MafbP54841 323 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp8a1P70704 1164 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly9Q01965 654 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Miga1Q4QQM5 600 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnm1lQ8K1M6 742 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha5Q91Y15 934 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psma8Q9CWH6 250 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp29Q9ES63 869 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NagaQ9QWR8 415 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plod3Q9R0E1 741 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk11Q9WTK7 436 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc16A2A5H4 111 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TyrobpO54885 114 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2bP62915 316 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf367Q0VDT2 340 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TbckQ8BM85 762 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3830417A13RikQ8BQJ2 303 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GlmnQ8BZM1 596 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmx4Q8C0L0 335 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iws1Q8C1D8 766 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtp1Q8C8C1 263 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calcoco1Q8CGU1 691 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ivns1abpQ920Q8 642 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gps2Q921N8 327 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp26Q99MX1 835 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tll2Q9WVM6 1012 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gfpt2Q9Z2Z9 682 aa13.58□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm45261A0A1B0GSP6 197 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdr2lA2A6T1 465 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam171a1A2ATK9 892 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhtkd1A2ATU0 921 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Per1O35973 1291 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Art2aP17981 287 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp3caP63328 521 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Irx1P81068 480 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klra9Q2TJJ8 266 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spryd7Q3TFQ1 196 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc169Q8BXX9 214 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc12a6Q924N4 1150 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dph5Q9CWQ0 281 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr5Q9JLF7 859 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B020004C17RikJ3QP07 232 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsg1l2M0QWL6 290 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtco1P00397 514 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb6Q60854 378 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prmt6Q6NZB1 378 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc25Q78PG9 208 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankfy1Q810B6 1169 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem161bQ8C2L6 487 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx22Q8K402 517 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bud13Q8R149 637 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Med15Q924H2 789 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RptorQ8K4Q0 1335 aa13.57□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DgkhD3YXJ0 1156 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GclmO09172 274 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GcP21614 476 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FechP22315 420 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map2k1P31938 393 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnni3P48787 211 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex35Q14BK3 207 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tatdn3Q3U1C6 294 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agxt2Q3UEG6 513 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6ka6Q7TPS0 764 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E330017A01RikQ8BU47 192 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olr1Q9EQ09 363 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlr2Q9QUN7 784 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb2b7D3YYY1 112 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp457L7N1X4 647 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DtnbO70585 659 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TdgP56581 421 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StamP70297 548 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdlim7Q3TJD7 457 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phactr4Q501J7 694 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Six2Q62232 296 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PodnQ7TQ62 611 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trnp1Q80ZI1 223 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AarsQ8BGQ7 968 aa13.56□□□□□ -0.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.2 ms