RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data10.37□□□□□ -0.75not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C MES1P00958 751 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C TPK3P05986 398 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C FBA1P14540 359 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C SAM35P14693 329 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C DEG1P31115 442 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C TAT1P38085 619 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C SWP82P43554 623 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C VOA1P53262 265 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C MRX8Q05473 314 aa10.37□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C KIN28P06242 306 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YJL016WP47072 561 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YDC1Q02896 317 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C HOT1Q03213 719 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C SMP3Q04174 516 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YGR161W-CQ3E744 92 aa10.36□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YAK1P14680 807 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C PEP12P32854 288 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C IPT1P38954 527 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C PUG1P40100 303 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C ATF1P40353 525 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C AAD14P42884 376 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C RET2P43621 546 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C CTK2P46962 323 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C PPT1P53043 513 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C SAY1P53324 424 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YNR064CP53750 290 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C SNZ1Q03148 297 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C DLT1Q04216 342 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR317WQ04893 1140 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C LOT6Q07923 191 aa10.35□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C MRT4P33201 236 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YHR035WP38769 630 aa10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C GZF3P42944 551 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C PST2Q12335 198 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
tM(CAU)CtM(CAU)C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C GEP7P53171 287 aa10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YMD8Q03697 442 aa10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YOR378WQ08902 515 aa10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C USB1Q12208 290 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C PCL9Q12477 304 aa10.33□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C FPS1P23900 669 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C FRM2P37261 193 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YPK3P38070 525 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SLM1P40485 686 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C RNH201P53942 307 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SAM50P53969 484 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C LSO1Q3E827 93 aa10.32□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C RAS1P01119 309 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YKL102CP34249 101 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YRB2P40517 327 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C HHT1P61830 136 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YDR114CQ04597 100 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YPR098CQ06089 161 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C ISA2Q12425 185 aa10.31□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C NAM2P11325 894 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SSE2P32590 693 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C REC114P32841 428 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YOX1P34161 385 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C ECM1P39715 212 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C FMP33P46998 180 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C MTL1P53214 551 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YNR048WP53740 393 aa10.3□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data10.3□□□□□ -0.76not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C ARC40P38328 384 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C BUD17P53727 317 aa10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C PIN3Q06449 215 aa10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C IRC25Q07951 179 aa10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YPL119C-AQ3E751 87 aa10.29□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C ATR1P13090 542 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C RPL30P14120 105 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C AST1P35183 429 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C GPI18P38211 433 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SLM4P38247 162 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SDP1P40479 209 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SUT1P53032 299 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C COG5P53951 403 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C YLR345WQ06137 509 aa10.28□□□□□ -0.76
tM(CAU)CtM(CAU)C SOD2P00447 233 aa10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C ECT1P33412 323 aa10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C TCM62P38228 572 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C RMD6P39975 231 aa10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C PIC2P40035 300 aa10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C PHB2P50085 310 aa10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C NOG1Q02892 647 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C IES6P32617 166 aa10.26□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C TIF3P34167 436 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C AIM10P39965 576 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C SNL1P40548 159 aa10.26□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C CIN2P46670 268 aa10.26□□□□□ -0.77
tM(CAU)CtM(CAU)C CCC1P47818 322 aa10.26□□□□□ -0.77
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