RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	ECT1	P33412	323 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DOA1	P36037	715 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PAU24	P38155	120 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	BNA4	P38169	460 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RRN10	P38204	145 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FET3	P38993	636 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	TIR3	P40552	269 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	AZF1	P41696	914 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	AIM25	P47140	327 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YGL101W	P53144	215 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	COG7	P53195	279 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VOA1	P53262	265 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RHO4	Q00246	291 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MSC1	Q03104	513 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YDR249C	Q03787	373 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RRN11	Q04712	507 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YKR104W	P0CE69	306 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ERD1	P16151	362 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	HXT2	P23585	541 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ITR1	P30605	584 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SKN1	P33336	771 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ECM15	P35195	104 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MTH1	P35198	433 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DTR1	P38125	572 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	THI2	P38141	450 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ICE2	P40499	491 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	POP1	P41812	875 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PGA1	P53896	198 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SPC3	Q12133	184 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YPR064W	Q12492	139 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	COX9	P07255	59 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CNB1	P25296	175 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ADE1	P27616	306 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PAU2	P32612	120 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VPS17	P32913	551 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SFC1	P33303	322 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RTC2	P38279	296 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MET30	P39014	640 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YER184C	P39961	794 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	LOH1	P47055	219 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	LCL3	P53153	274 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	JAC1	P53193	184 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YGR066C	P53242	292 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	KAP120	Q02932	1032 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	TMN2	Q04562	672 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ROY1	Q04847	553 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CYK3	Q07533	885 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VPS68	Q12016	184 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MDM35	O60200	86 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	REP2	P03872	296 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YCR100C	P25606	316 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ATS1	P31386	333 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ORC2	P32833	620 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.1	□□□□□ -1.59	not detected
PSH1	YOL054W	YHR122W	P38829	231 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DOC1	P53068	250 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SGF73	P53165	657 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SAY1	P53324	424 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DCR2	Q05924	578 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	KEI1	Q06346	221 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YEH1	Q07804	573 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	BTS1	Q12051	335 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YDL211C	Q12121	372 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	INP53	Q12271	1107 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SKS1	Q12505	502 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PUT1	P09368	476 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPB5	P20434	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms