RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	PMT5	P52867	743 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MEP3	P53390	489 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	CBS1	P14066	229 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YPK2	P18961	677 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	HMX1	P32339	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DUT1	P33317	147 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ECM31	P38122	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ERV46	P39727	415 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AGX1	P43567	385 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BNA1	P47096	177 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	EKI1	Q03764	534 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	URA3	P03962	267 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
RRP5	YMR229C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	POP2	P39008	433 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MET30	P39014	640 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FMP52	P40008	231 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SHO1	P40073	367 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	REE1	P40893	198 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SNG1	P46950	547 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YJR056C	P47115	236 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AAT1	Q01802	451 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ERV2	Q12284	196 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	NPC2	Q12408	173 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TFC7	Q12415	435 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LDB16	P25587	256 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	STB5	P38699	743 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	OTU1	P43558	301 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YJR115W	P47152	169 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	EOS1	P53938	366 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PNG1	Q02890	363 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RNH202	Q05635	350 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MSC3	Q05812	728 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RRT7	Q07829	113 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PSF1	Q12488	208 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YOL162W	P0CF19	215 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FUN14	P18411	198 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YHR180W	P38868	163 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IRC24	P40580	263 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	IRC7	P43623	340 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RPA43	P46669	326 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LIP2	Q06005	328 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YLR173W	Q06247	608 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FRE7	Q12333	620 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	URA6	P15700	204 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	LDS1	P31379	325 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YEL073C	P39974	107 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	AVT7	P40501	490 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	UBP8	P50102	471 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YNR048W	P53740	393 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YNR066C	P53752	436 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	SAE3	P89114	91 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	APS2	Q00381	147 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	YPL257W	Q08974	193 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MMP1	Q12372	583 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	POP5	P28005	173 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MRPL9	P31334	269 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	GUT2	P32191	649 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	PAU2	P32612	120 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RRP5	YMR229C	MNN2	P38069	597 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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