RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W STE18P18852 110 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SPS19P32573 292 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MRP21P38175 177 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data2.77□□□□□ -1.97not detected
SNX4YJL036W GPI18P38211 433 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SER33P40510 469 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W DSN1P40568 576 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W FMP48P53233 369 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W INP1Q03694 420 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W API2Q04413 109 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MHR1Q06630 226 aa2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W POX1P13711 748 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RPO26P20435 155 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W IMP1P28627 190 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MGM101P32787 269 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W JEN1P36035 616 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CBT1P36038 271 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W FRM2P37261 193 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RIB1P38066 345 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MBA1P38300 278 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W KRE29P40026 464 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YIL012WP40551 113 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YRB1P41920 201 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RPC17P47076 161 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YJR079WP47126 109 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SWS2P53937 143 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YPR098CQ06089 161 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YCT1Q12235 531 aa2.76□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W COX4P04037 155 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W FUS3P16892 353 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YMR31P19955 123 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W EPT1P22140 391 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YCR025CP25352 136 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ATG15P25641 520 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MRPL3P36516 390 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MED8P38304 223 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CUE1P38428 203 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RTC3P38804 111 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W AVT7P40501 490 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W NBP35P52920 328 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YMR244WQ04018 355 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W PEX10Q05568 337 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YPR172WQ06608 200 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YOL029CQ08187 201 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W GET4Q12125 312 aa2.75□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CDC33P07260 213 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RPL4AP10664 362 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YCR102CP25608 368 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W FZO1P38297 855 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ERG28P40030 148 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RAD17P48581 401 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MRS2Q01926 470 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YPL113CQ02961 396 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W VHS1Q03785 461 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ATG17Q06410 417 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YDR018CQ12185 396 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W TRM10Q12400 293 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W NCB2Q92317 146 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SEY1Q99287 776 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa2.74□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YBR121C-AP0C5L4 52 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SGE1P33335 543 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W TIP20P33891 701 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YNL194CP40169 301 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YFL064CP43540 174 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CTF19Q02732 369 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SDC1Q03323 175 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W LOA1Q06508 300 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RAX2Q12465 1220 aa2.73□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W JIP3O13555 125 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W MATALPHA2P0CY08 210 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W VPH2P32341 215 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W CAT2P32796 670 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ZRT3P34240 503 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W SMP1P38128 452 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W POP8P38208 133 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W YBR096WP38256 230 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W ECM34P38728 170 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RRT13P40042 185 aa2.72□□□□□ -1.97
SNX4YJL036W RRG9P40156 214 aa2.72□□□□□ -1.97
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