RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	RTT105	P40063	208 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HNT2	P49775	206 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	NUP116	Q02630	1113 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	COX20	Q04935	205 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	REX3	Q12090	404 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	INP53	Q12271	1107 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	IRA2	P19158	3079 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	QCR7	P00128	127 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	COX9	P07255	59 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PET54	P10834	293 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CDC26	P14724	124 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CTA1	P15202	515 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	STE18	P18852	110 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YBR242W	P38331	238 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RPE1	P46969	238 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	COA4	Q05809	96 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	BAG7	Q12128	409 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SPS2	P08459	502 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SCO1	P23833	295 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SFK1	P35735	353 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SDS24	P38314	527 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MLH1	P38920	769 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YIL067C	P40514	678 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CAT5	P41735	233 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	CUP9	P41817	306 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YGR066C	P53242	292 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PET191	Q02772	108 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	ATG21	Q02887	496 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	GIS1	Q03833	894 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	BNA7	Q04066	261 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	SPR28	Q04921	423 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MRX8	Q05473	314 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	DCR2	Q05924	578 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	IRC19	Q07843	230 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YOR376W	Q08900	122 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PIN2	Q12057	282 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	MDM32	Q12171	622 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HMS1	Q12398	434 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	YOS9	Q99220	542 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YCK1	YHR135C	HOM3	P10869	527 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CWH43	P25618	953 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CNE1	P27825	502 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ATS1	P31386	333 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RPC34	P32910	317 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PKP1	P40530	394 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	BNA6	P43619	295 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ASK10	P48361	1146 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ORM1	P53224	222 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YGR126W	P53274	230 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	BUD25	P85052	153 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YPL272C	Q08984	517 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SWM1	Q12379	170 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MTR10	Q99189	972 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	STE50	P25344	346 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ITR1	P30605	584 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SPT10	P35208	640 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
YCK1	YHR135C	YER010C	P40011	234 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MNN5	P46982	586 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PMT3	P47190	753 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	GNP1	P48813	663 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YGL204C	P53089	101 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YIP4	P53093	235 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	FMP48	P53233	369 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SCS7	Q03529	384 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	ORM2	Q06144	216 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	KEI1	Q06346	221 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	HEM25	Q07534	307 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YRM1	Q12340	786 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SGA1	P08019	549 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PRB1	P09232	635 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	COS9	P36034	407 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	OM14	P38325	134 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	NIT2	P47016	307 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	CCC1	P47818	322 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YGR042W	P53227	271 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	VHT1	P53241	593 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	MRPS16	Q02608	121 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	YDR102C	Q03864	110 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	PEX30	Q06169	523 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	AKR2	Q12013	749 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YCK1	YHR135C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54

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