RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ERV29P53337 310 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W BSC5P53755 489 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ASI3P53983 676 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MRX8Q05473 314 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YBR056W-AI2HB52 66 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SOD2P00447 233 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ADK1P07170 222 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W DBF2P22204 572 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PTC6P25646 442 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W HOM6P31116 359 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SFK1P35735 353 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W APD1P38281 316 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MNN5P46982 586 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W IRC18P47056 224 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W RMD9P53140 646 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PCP1P53259 346 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YDR102CQ03864 110 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PEX10Q05568 337 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CTS2Q06350 511 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TPO3Q06451 622 aa7.85□□□□□ -1.15
DDI1YER143W GCN4P03069 281 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W DIT1P21623 536 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MSS4P38994 779 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YEL057CP39983 233 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W BNA6P43619 295 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ARO8P53090 500 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W Q0144Q9ZZW2 109 aa7.84□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RPC34P32910 317 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RIB7P33312 244 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SOF1P33750 489 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SEC66P33754 206 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MGE1P38523 228 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W TPN1P53099 579 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W KAP120Q02932 1032 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PHO92Q06390 306 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W ASR1Q06834 288 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SSK1Q07084 712 aa7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
DDI1YER143W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W CAP2P13517 287 aa7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SPT10P35208 640 aa7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YIP4P53093 235 aa7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W NNT1Q05874 261 aa7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W TMS1Q12116 473 aa7.82□□□□□ -1.16
DDI1YER143W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SCEIP03882 235 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MSW1P04803 379 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MATALPHA1P0CY06 175 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W HMLALPHA1P0CY07 175 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SPO7P18410 259 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PCL1P24867 279 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PRE4P30657 266 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W HTD2P38790 280 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W AIM20P40451 204 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W ADO1P47143 340 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YLR152CP54072 576 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W COQ11Q05892 277 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W HEM25Q07534 307 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W BLM10P43583 2143 aa7.81□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RPB10P22139 70 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W CNE1P27825 502 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W ERG9P29704 444 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MTC6P38849 526 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RTT105P40063 208 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YKE4P40544 346 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W MSE1P48525 536 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YNR040WP53736 256 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YNL165WP53891 406 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SAM50P53969 484 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W GAS2Q06135 555 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YPL199CQ08954 240 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W INP53Q12271 1107 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W ORT1Q12375 292 aa7.8□□□□□ -1.16
DDI1YER143W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PRB1P09232 635 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PDA1P16387 420 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W FRM2P37261 193 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W TAT1P38085 619 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W HPA3P39979 161 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PUG1P40100 303 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W SLZ1P40167 298 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W NIT3P49954 291 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W YGL260WP53056 76 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W PEX30Q06169 523 aa7.79□□□□□ -1.16
DDI1YER143W KEI1Q06346 221 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 126.8 ms