RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	GLN3	P18494	730 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SEC22	P22214	214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	HCM1	P25364	564 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	INO2	P26798	304 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	UBC8	P28263	218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CPR5	P35176	225 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MRPL3	P36516	390 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	SEN34	P39707	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PHB1	P40961	287 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YNL320W	P42840	284 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AIM23	P47015	356 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	APS3	P47064	194 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MOG1	P47123	218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	JAC1	P53193	184 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	POP6	P53218	158 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TDA1	Q03533	586 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AIM34	Q03673	198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	DPP1	Q05521	289 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MMT2	Q08970	484 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RPN6	Q12377	434 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AGC1	Q12482	902 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MDS3	P53094	1487 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	IFM1	P25038	676 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TRX3	P25372	127 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YKL075C	P36083	450 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PHD1	P36093	366 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	MTC6	P38849	526 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	FMP32	P43557	207 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PDR17	P53844	350 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	COG5	P53951	403 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	GAS2	Q06135	555 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TPO3	Q06451	622 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TIM18	Q08749	192 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	PFA4	Q12006	378 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX8	YER116C	TAF2	P23255	1407 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COX5A	P00424	153 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SPT3	P06844	337 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COS2	P0CX12	379 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COS3	P0CX13	379 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SPC34	P36131	295 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YKR041W	P36134	250 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	OXA1	P39952	402 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YIL029C	P40538	142 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COS6	P53344	381 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	DYN3	Q04949	312 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PEX30	Q06169	523 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	RDI1	Q12434	202 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CTA1	P15202	515 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	PDC2	P32896	925 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CSG2	P35206	410 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MRPL28	P36527	147 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MST28	P39552	234 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CSM2	P40465	213 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SER33	P40510	469 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CPR7	P47103	393 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CCC1	P47818	322 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	COS1	P53822	381 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YNL234W	P53857	426 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SWS2	P53937	143 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	IRC15	Q02733	499 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	ODC1	Q03028	310 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YET2	Q04210	160 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	GMC1	Q04399	608 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	TAF9	Q05027	157 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BNA5	Q05979	453 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BBP1	Q12365	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MRX4	Q12467	430 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	IGO2	Q9P305	131 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	CDC8	P00572	216 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	YCR023C	P25351	611 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	MGT1	P26188	188 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX8	YER116C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85

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