RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	AVO2	Q04749	426 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NUS1	Q12063	375 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ERP3	Q12403	225 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TIM9	O74700	87 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MSW1	P04803	379 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPB5	P20434	215 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SEC22	P22214	214 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PRE8	P23639	250 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PBN1	P25580	416 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	URA10	P30402	227 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SFP1	P32432	683 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	UPS2	P35200	230 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
XRS2	YDR369C	AGP2	P38090	596 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YEL057C	P39983	233 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NIT1	P40447	199 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RMD8	P43620	662 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YJL163C	P46996	555 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SAM37	P50110	327 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ELC1	Q03071	99 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUN1	Q06991	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HEM25	Q07534	307 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU23	Q07987	124 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YDR056C	Q12025	205 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PAU17	Q12370	124 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ISA2	Q12425	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MYO1	P08964	1928 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SAL1	D6W196	494 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUT1	P09368	476 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TIR1	P10863	254 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BCS1	P32839	456 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YBR063C	P38083	404 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RTC2	P38279	296 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YHR177W	P38867	453 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SPG5	P42933	373 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BIT61	P47041	543 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BUL1	P48524	976 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MGA1	P53050	456 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PRM8	P53174	237 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SPP2	Q02521	185 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GAS3	Q03655	524 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CDD1	Q06549	142 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLR118C	Q12354	227 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FRE6	Q12473	712 aa		3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SRD1	P09007	221 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CBS1	P14066	229 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SRB5	P32585	307 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TIP20	P33891	701 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CUE1	P38428	203 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FIR1	P40020	876 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YER085C	P40058	173 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YER158C	P40095	573 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUG1	P40100	303 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	OTU1	P43558	301 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SBH2	P52871	88 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BUD9	P53226	547 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PUS6	P53294	404 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HST3	P53687	447 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GOT1	Q03554	138 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MSS11	Q03825	758 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GIS1	Q03833	894 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	DAL4	Q04895	635 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	HRD3	Q05787	833 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	NUT2	Q06213	157 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLR030W	Q07967	263 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	CSI2	Q08054	341 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GAS5	Q08193	484 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RDR1	Q08904	546 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PIN2	Q12057	282 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RKI1	Q12189	258 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SIA1	Q12212	622 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	PRR2	Q12310	699 aa		3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
XRS2	YDR369C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88

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