RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PTCH1	Q13635	1447 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM1A	O60341	852 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT37	O76014	449 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	OSM	P13725	252 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCA1	P28370	1054 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPHS1	P49903	392 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CACNB3	P54284	484 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	APBA1	Q02410	837 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO4	Q32M45	955 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CBLL1	Q75N03	491 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXW5	Q969U6	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC14	Q96N46	770 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TMX2	Q9Y320	296 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NWD1	Q149M9	1564 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CPS1	P31327	1500 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRU	Q92729	1446 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC7	Q96M83	1385 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616		H7C1D1	291 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR1B	P28222	390 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	LTBR	P36941	435 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	BLMH	Q13867	455 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PGS1	Q32NB8	556 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KSR1	Q8IVT5	923 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT16	Q8N8M0	369 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PHKB	Q93100	1093 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPN8	A6NHC0	703 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	BAIAP3	O94812	1187 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	HPX	P02790	462 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ERVFC1	P60507	584 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ST5	P78524	1137 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBED6	P86452	979 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRNE	Q04844	493 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ICA1	Q05084	483 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKG2	Q13237	762 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SPECC1	Q5M775	1068 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	OXR1	Q8N573	874 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	NELL1	Q92832	810 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	COA7	Q96BR5	231 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX11	Q96FC9	970 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	BOC	Q9BWV1	1114 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	SP110	Q9HB58	689 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48

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