RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.61■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 SPTLC2O15270 562 aa29.61■■■□□ 2.33
BRD4-208ENST00000597315 TBCAO75347 108 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 SLC11A1P49279 550 aa29.61■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa29.6■■■□□ 2.33
BRD4-208ENST00000597315 H3BQ06 376 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
BRD4-208ENST00000597315 FSCN2O14926 492 aa29.59■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 YEATS4O95619 227 aa29.58■■■□□ 2.33
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BRD4-208ENST00000597315 CTC1Q2NKJ3 1217 aa29.56■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 ATL3Q6DD88 541 aa29.56■■■□□ 2.32
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BRD4-208ENST00000597315 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.56■■■□□ 2.32
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BRD4-208ENST00000597315 LRRC15Q8TF66 581 aa29.56■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
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BRD4-208ENST00000597315 K7ENM7 598 aa29.55■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 LINC01565O15544 149 aa29.55■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 SCP2P22307 547 aa29.55■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.322e-8■■□□□ 12.5
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BRD4-208ENST00000597315 ZBTB33Q86T24 672 aa29.55■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 PANK2Q9BZ23 570 aa29.55■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 TRAK2O60296 914 aa29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 B4GALT3O60512 393 aa29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 THP07101 528 aa29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 MAPTP10636 758 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 ABCD1P33897 745 aa29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 NCKAP1LP55160 1127 aa29.54■■■□□ 2.32
BRD4-208ENST00000597315 DSC1Q08554 894 aa29.54■■■□□ 2.32
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