RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591956.1

SNHG16-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

TSL 2

Gene SNHG16, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-208	ENST00000591956	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MCL1	Q07820	350 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GPM6B	Q13491	265 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	XKR4	Q5GH76	650 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KANK3	Q6NY19	840 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	URGCP	Q8TCY9	931 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ABLIM1	O14639	778 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CLDN3	O15551	220 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NCK2	O43639	380 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PPP1R37	O75864	691 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	POSTN	Q15063	836 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	DYM	Q7RTS9	669 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PANK4	Q9NVE7	773 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NCOR1	O75376	2440 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NPTXR	O95502	500 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ADRB2	P07550	413 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CTNNB1	P35222	781 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GRM5	P41594	1212 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GATM	P50440	423 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KRT17	Q04695	432 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EHHADH	Q08426	723 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	DSC1	Q08554	894 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PSMD2	Q13200	908 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GPR65	Q8IYL9	337 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LPP	Q93052	612 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	DHX58	Q96C10	678 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF558	Q96NG5	402 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SPG21	Q9NZD8	308 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956		A0A0B4J269	797 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956		A0A1B0GVL5	298 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RFXAP	O00287	272 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NR1I2	O75469	434 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	FGF18	O76093	207 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ZNF202	O95125	648 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EDN1	P05305	212 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ITGB1	P05556	798 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	GALT	P07902	379 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PFKFB1	P16118	471 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	SYK	P43405	635 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	BCAR1	P56945	870 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CD302	Q8IX05	232 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	PAGE5	Q96GU1	130 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	ACAP3	Q96P50	834 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SNHG16-208	ENST00000591956	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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