RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 NARFQ9UHQ1 456 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 PASKQ96RG2 1323 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PAPLNO95428 1278 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 STARD3NLO95772 234 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MMEP08473 750 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ITGB5P18084 799 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ENPP1P22413 925 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 FBLN1P23142 703 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CHRNA5P30532 468 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 THBS2P35442 1172 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 BIRC2Q13490 618 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MOGSQ13724 837 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 UBE4AQ14139 1066 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 UGT8Q16880 541 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 GORABQ5T7V8 394 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PROSER1Q86XN7 944 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MORC4Q8TE76 937 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PMM1Q92871 262 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 FERMT2Q96AC1 680 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TEKT5Q96M29 485 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 GBP4Q96PP9 640 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ANO3Q9BYT9 981 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 HACL1Q9UJ83 578 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ERC2O15083 957 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 APOL3O95236 402 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINB2P05120 415 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AOAHP28039 575 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 VIPR1P32241 457 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 KCNMB1Q16558 191 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CR1LQ2VPA4 569 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CT83Q5H943 113 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TOR2AQ5JU69 321 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TEPPQ6URK8 271 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CNTROBQ8N137 903 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 AIFM3Q96NN9 605 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CSRNP2Q9H175 543 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ASB1Q9Y576 335 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RGPD5Q99666 1765 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 PCNTO95613 3336 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 KDRP35968 1356 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 BIN1O00499 593 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MTHFD2P13995 350 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 DDR1Q08345 913 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 BRD3Q15059 726 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TTC38Q5R3I4 469 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CD276Q5ZPR3 534 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CERS3Q8IU89 383 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MIER2Q8N344 545 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 JADE3Q92613 823 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 ALG3Q92685 438 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RAX2Q96IS3 184 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 POFUT1Q9H488 388 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 EDARQ9UNE0 448 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 WASF3Q9UPY6 502 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-208ENST00000578600 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.75□□□□□ -1.33
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