RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF165	P49910	485 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SPATA1	Q5VX52	437 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	IL23A	Q9NPF7	189 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	RGS18	Q9NS28	235 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	USP20	Q9Y2K6	914 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SMTNL1	A8MU46	457 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	IKBKB	O14920	756 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CETN3	O15182	167 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	OGT	O15294	1046 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CSF2RA	P15509	400 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	RAB27A	P51159	221 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FAM189B	P81408	668 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FPGS	Q05932	587 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ADAM9	Q13443	819 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	IKBKE	Q14164	716 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	HACE1	Q8IYU2	909 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	BAD	Q92934	168 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ADAM2	Q99965	735 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CDT1	Q9H211	546 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691		A0A0U1RQF3	1178 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ENPP3	O14638	875 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CLIC2	O15247	247 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MAPK13	O15264	365 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	ACTN1	P12814	892 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	NR2F2	P24468	414 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	STX17	P56962	302 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MYL5	Q02045	173 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	UBXN11	Q5T124	520 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FBXL18	Q96ME1	805 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	MED15	Q96RN5	788 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		18.33	■□□□□ 0.53
TBCD-223	ENST00000576691	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	TISP43	B9A030	160 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	EXTL3	O43909	919 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	EXOC3	O60645	756 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	BAIAP3	O94812	1187 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	GNA14	O95837	355 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	EOMES	O95936	686 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB33	Q86T24	672 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	GPD1L	Q8N335	351 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	VWCE	Q96DN2	955 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF233	A6NK53	670 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691		C9IYK1	514 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	MGEA5	O60502	916 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	NPTXR	O95502	500 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	CLTA	P09496	248 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	SYN1	P17600	705 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	GRM5	P41594	1212 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	PGBD4	Q96DM1	585 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	LRCH3	Q96II8	777 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	THAP9	Q9H5L6	903 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	BECN2	A8MW95	431 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TBCD-223	ENST00000576691	FAM189A1	O60320	539 aa		18.31	■□□□□ 0.52

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