RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 GHRP10912 638 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF844Q08AG5 666 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFT88Q13099 833 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNAPC2Q13487 334 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYBPC2Q14324 1141 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPN18Q99952 460 aa21.89■■□□□ 1.1
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CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.89■■□□□ 1.1
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CCNDBP1-205ENST00000564630 SREBF2Q12772 1141 aa21.89■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 MAATS1Q7Z4T9 603 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.89■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CENPTQ96BT3 561 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 K7ENM7 598 aa21.87■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGA4P13612 1032 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 RFX1P22670 979 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSD17B4P51659 736 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP2R2AP63151 447 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 XRCC4Q13426 336 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR2Q13614 643 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF22Q14807 665 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 PADI6Q6TGC4 694 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 SGSM3Q96HU1 749 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 WBP1LQ9NX94 342 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITGB5P18084 799 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNFAIP3P21580 790 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 TM4SF4P48230 202 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSEN1P49768 467 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.87■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 RDH13Q8NBN7 331 aa21.87■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 BCRP11274 1271 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCB4P21439 1286 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 IFNL1Q8IU54 200 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 GINM1Q9NU53 330 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPTORQ8N122 1335 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXCL11O14625 94 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT13P13646 458 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGEF26Q96DR7 871 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.86■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM206Q9H813 350 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF186Q9NXI6 227 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP83Q9Y592 693 aa21.85■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD62A6NC57 917 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTBD19C9JJ37 291 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ICAM1P05362 532 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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