RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TM4SF1P30408 202 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ADD2P35612 726 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ITGA1P56199 1179 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CHRNDQ07001 517 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 KRT32Q14532 448 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CCDC103Q8IW40 242 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CCDC83Q8IWF9 413 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 INVSQ9Y283 1065 aa6.37□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FSD2A1L4K1 749 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MATN3O15232 486 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 LCP1P13796 627 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SLC5A1P13866 664 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PTMSP20962 102 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FPR2P25090 351 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 HSD3B2P26439 372 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD1Q15327 319 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 UBE3CQ15386 1083 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TKFCQ3LXA3 575 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PRR31Q5SQ13 230 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 NECAB1Q8N987 351 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SEC14L1Q92503 715 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 DIO2Q92813 273 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 LOXL4Q96JB6 756 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C8orf49Q96NF6 230 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ITGB4P16144 1822 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.36□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 E7EWF7 191 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FGAP02671 866 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PDE6AP16499 860 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZNF20P17024 532 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SYT1P21579 422 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 GJB2P29033 226 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 LTBRP36941 435 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 STAT5AP42229 794 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TCEA2Q15560 299 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CPZQ66K79 652 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MCTP2Q6DN12 878 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 IQCEQ6IPM2 695 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZUG5 572 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SPATA5Q8NB90 893 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 DCAF4Q8WV16 495 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SAMD11Q96NU1 681 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MTMR6Q9Y217 621 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.35□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 RREB1Q92766 1687 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MROH6A6NGR9 719 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 GPAA1O43292 621 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 STX6O43752 255 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SLC6A11P48066 632 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 RPS8P62241 208 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 ZXDAP98168 799 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 UBE4AQ14139 1066 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 LGI4Q8N135 537 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 FBXL16Q8N461 479 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.34□□□□□ -1.39
TRDN-205ENST00000546248 TTLL6Q8N841 843 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms