RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CASC4Q6P4E1 433 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ATG4CQ96DT6 458 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.68□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PIK3R2O00459 728 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PSAPP07602 524 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPA6P17066 643 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 BPIFB4P59827 614 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CDO1Q16878 200 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 BBS9Q3SYG4 887 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ICE2Q659A1 982 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TTC16Q8NEE8 873 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM151AQ8WW52 585 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CYFIP2Q96F07 1278 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 COX16Q9P0S2 106 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ASTN1O14525 1302 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 FLT3P36888 993 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP2R5AQ15172 486 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CROCCP2Q86T23 111 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CHMP6Q96FZ7 201 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SUN1O94901 812 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 NR3C2P08235 984 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CA4P22748 312 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MARCKSL1P49006 195 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF449Q6P9G9 518 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC18Q9H819 358 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MYH8P13535 1937 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 NUP98P52948 1817 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF1P21675 1872 aa13.67□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 AGPSO00116 658 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TGFB1I1O43294 461 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 STAM2O75886 525 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 NEBLO76041 1014 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SESN3P58005 492 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ADCY2Q08462 1091 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 Q4G0T1 1027 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SPOPLQ6IQ16 392 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ETNPPLQ8TBG4 499 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TATDN2Q93075 761 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 HVCN1Q96D96 273 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 GMCL1Q96IK5 515 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 RASA4BC9J798 803 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 RASA4O43374 803 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP3CAQ08209 521 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SNCBQ16143 134 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 DCAF15Q66K64 600 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 PALB2Q86YC2 1186 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM7Q9C029 511 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 GNA15P30679 374 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 KRT76Q01546 638 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TKFCQ3LXA3 575 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 HAUS2Q9NVX0 235 aa13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 H7C0C1 242 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP5OP48047 213 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM68Q6AZZ1 485 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MKNK1Q9BUB5 465 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 APOL6Q9BWW8 343 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 WNT8AQ9H1J5 351 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 OLFML3Q9NRN5 406 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TMX2Q9Y320 296 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP6O75581 1613 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SPEF2Q9C093 1822 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 SNHG28P0DPA3 235 aa13.65□□□□□ -0.22
RABGEF1-211ENST00000503687 FECHP22830 423 aa13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms