RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496013.5

FBXO18-216, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO18, Length 336 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-216ENST00000496013 ZNF28P17035 718 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RRADP55042 308 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 UBE3CQ15386 1083 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 PRR31Q5SQ13 230 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 IL31Q6EBC2 164 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ABHD15Q6UXT9 468 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SNX33Q8WV41 574 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RGMAQ96B86 450 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 NUDT11Q96G61 164 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TDP1Q9NUW8 608 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CFAP74Q9C0B2 1584 aa4.9□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 BCORL1Q5H9F3 1711 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 FANCAO15360 1455 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TCAF2A6NFQ2 919 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RFXAPO00287 272 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 B3GALT2O43825 422 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TUSC2O75896 110 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 KLHL18O94889 574 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ZBED1O96006 694 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ALDH2P05091 517 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RHCEP18577 417 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 PI3P19957 117 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 GLDCP23378 1020 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 HTR1BP28222 390 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 IL12RB1P42701 662 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 MRE11P49959 708 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 USP14P54578 494 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RHDQ02161 417 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ADAM15Q13444 863 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 PCOLCEQ15113 449 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 KIAA0753Q2KHM9 967 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 DAAM2Q86T65 1068 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RSPH3Q86UC2 560 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 Q8N3U1 123 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SVIPQ8NHG7 77 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 FBXO41Q8TF61 875 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CGRRF1Q99675 332 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TLR9Q9NR96 1032 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CHST12Q9NRB3 414 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.89□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 NEO1Q92859 1461 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ANO9A1A5B4 782 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 A6NNZ2 444 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 APAF1O14727 1248 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SLC16A6O15403 523 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SGTAO43765 313 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ALDH1A2O94788 518 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 NEK3P51956 506 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CACNB3P54284 484 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 FAM193AP78312 1265 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 GALEQ14376 348 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SSPNQ14714 243 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SEPT2Q15019 361 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 GORABQ5T7V8 394 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 KRT40Q6A162 431 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 MCTP2Q6DN12 878 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 Q6ZUG5 572 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 CLEC14AQ86T13 490 aa4.88□□□□□ -1.63
FBXO18-216ENST00000496013 SAPCD2Q86UD0 394 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms