RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTB-209ENST00000473406 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.15□□□□□ -1.26
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RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP26A1O43174 497 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL4CP56559 192 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4F8P98187 520 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRNEQ04844 493 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT5Q09328 741 aa7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 IKZF1Q13422 519 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 POSTNQ15063 836 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF12Q16514 161 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 AOC3Q16853 763 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR156Q8NFN8 814 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 PEX11GQ96HA9 241 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_1984214I3L0E3 225 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 EYA2O00167 538 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 CUTAO60888 179 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ENDOD1O94919 500 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD4O95243 580 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 THBS2P35442 1172 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 RXRGP48443 463 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 NFATC3Q12968 1075 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 9.7
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RABGGTB-209ENST00000473406 PFKFB4Q16877 469 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 RETSATQ6NUM9 610 aa7.13□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 ATP11CQ8NB49 1132 aa7.13□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 FGFR2P21802 821 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 STK32BQ9NY57 414 aa7.12□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF839A8K0R7 811 aa7.11□□□□□ -1.27
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RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS16A8MUM7 142 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT5O00445 386 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ACKR2O00590 384 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 SRGAP3O43295 1099 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 DBHP09172 617 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGGTB-209ENST00000473406 ITGA8P53708 1063 aa7.11□□□□□ -1.27
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