RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 SCNN1GP51170 649 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 NRN1LQ496H8 165 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 ST8SIA2Q92186 375 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 DPF2Q92785 391 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 CEP95Q96GE4 821 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.14□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 KLHL33A6NCF5 533 aa9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 MFAP3LO75121 409 aa9.13□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 ACRV1P26436 265 aa9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 SEPT2Q15019 361 aa9.13□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 GGNQ86UU5 652 aa9.13□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 CYP27B1O15528 508 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 RABGGTBP53611 331 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 IGBP1P78318 339 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.12□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 IL17DQ8TAD2 202 aa9.12□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 NRG4Q8WWG1 115 aa9.12□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 GPR87Q9BY21 358 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 OR7D4Q8NG98 312 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 INTUQ9ULD6 942 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.1□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 STON2Q8WXE9 905 aa9.1□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 MNTQ99583 582 aa9.1□□□□□ -0.95
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SGCE-210ENST00000472326 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.1□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 SLC6A9P48067 706 aa9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 FAM83AQ86UY5 434 aa9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.09□□□□□ -0.95
SGCE-210ENST00000472326 MATN3O15232 486 aa9.08□□□□□ -0.96
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SGCE-210ENST00000472326 CCND1P24385 295 aa9.08□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 DGCR2P98153 550 aa9.08□□□□□ -0.96
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SGCE-210ENST00000472326 SPON1Q9HCB6 807 aa9.08□□□□□ -0.96
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SGCE-210ENST00000472326 C1SP09871 688 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 PTTG1IPP53801 180 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
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SGCE-210ENST00000472326 DOK3Q7L591 496 aa9.07□□□□□ -0.96
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SGCE-210ENST00000472326 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 RAB24Q969Q5 203 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 KCNH6Q9H252 994 aa9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SGCE-210ENST00000472326 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.06□□□□□ -0.96
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