RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RUFY3Q7L099 469 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RSAD1Q9HA92 442 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PRR23AA6NEV1 266 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CPLX1O14810 134 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 MTERF2Q49AM1 385 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 VCANP13611 3396 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 A0A087WZ62 844 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KLRC2P26717 231 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 UGCGQ16739 394 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 LETM2Q2VYF4 491 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NOTUMQ6P988 496 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RNF169Q8NCN4 708 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KIF18AQ8NI77 898 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 EDIL3O43854 480 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 BRD1O95696 1058 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ITGA4P13612 1032 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 HOXA9P31269 272 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SLC11A1P49279 550 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 DSG1Q02413 1049 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 DSC1Q08554 894 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ANO5Q75V66 913 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 NEK8Q86SG6 692 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SHDQ96IW2 340 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 TSPY26PQ9H489 355 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 ST7Q9NRC1 585 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 USP25Q9UHP3 1055 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 VAV3Q9UKW4 847 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-204ENST00000440835 C2orf16Q68DN1 1984 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ERLIN2O94905 339 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GLUD1P00367 558 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SDHBP21912 280 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MUTP22033 750 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GLUD2P49448 558 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MYBPC2Q14324 1141 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SETDB1Q15047 1291 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 FERMT3Q86UX7 667 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 TMX3Q96JJ7 454 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 IER2Q9BTL4 223 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CSRNP2Q9H175 543 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 MUC3AQ02505 3323 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CLUHO75153 1309 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 CHMP2AO43633 222 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 DGAT1O75907 488 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 ADCY5O95622 1261 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PRR29P0C7W0 189 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 SRFP11831 508 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 EPCAMP16422 314 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 PTENP60484 403 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-204ENST00000440835 GRIK3Q13003 919 aa6.64□□□□□ -1.35
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