RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF39	Q9H2S5	420 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	DMD	P11532	3685 aa		19.65	■□□□□ 0.74
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR23A	A6NEV1	266 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	B4GALT5	O43286	388 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CLCN5	P51795	746 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GIT2	Q14161	759 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GBP3	Q9H0R5	595 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	HES2	Q9Y543	173 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		19.64	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GUA9	196 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	POMC	P01189	267 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP11B2	P19099	503 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	DSC1	Q08554	894 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGDR	Q13258	359 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PDIA5	Q14554	519 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM187B	Q17R55	369 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	KANK3	Q6NY19	840 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PADI6	Q6TGC4	694 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	TMX3	Q96JJ7	454 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	FZD8	Q9H461	694 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	STK39	Q9UEW8	545 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		19.63	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL5C	A6NH57	179 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	NRP1	O14786	923 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH2	P05091	517 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	EPCAM	P16422	314 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	MLH1	P40692	756 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	BSND	Q8WZ55	320 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GAD1	Q99259	594 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	MARCH5	Q9NX47	278 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	MIOS	Q9NXC5	875 aa		19.62	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	LAD1	O00515	517 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	LILRB3	O75022	631 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	EFEMP2	O95967	443 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPH	P41219	470 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN14	Q15678	1187 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP42	Q96MM3	310 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF3A	Q9Y496	699 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	STK24	Q9Y6E0	443 aa		19.61	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	NPTXR	O95502	500 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	NAMPT	P43490	491 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	SCNN1G	P51170	649 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	IL17A	Q16552	155 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CABP7	Q86V35	215 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		19.6	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR149	Q86SP6	731 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	HACE1	Q8IYU2	909 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB34	Q9BZG1	259 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
MRPL28-203	ENST00000429738	ACKR2	O00590	384 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MRPL28-203	ENST00000429738	SOD2	P04179	222 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MRPL28-203	ENST00000429738	EDN1	P05305	212 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP5	P24588	427 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB2	P29033	226 aa		19.58	■□□□□ 0.72
MRPL28-203	ENST00000429738	MCM2	P49736	904 aa		19.58	■□□□□ 0.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms