RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 KLRC2P26717 231 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 OR1G1P47890 313 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GRIK3Q13003 919 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR3Q13615 1198 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GPR149Q86SP6 731 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.24■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ADH1AP07327 375 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 GLUD2P49448 558 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 DSG1Q02413 1049 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 TTC38Q5R3I4 469 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 POTEGQ6S5H5 508 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB33Q86T24 672 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 KIF2CQ99661 725 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 COLEC11Q9BWP8 271 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 RXFP1Q9HBX9 757 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 CHST7Q9NS84 486 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 DPP7Q9UHL4 492 aa23.23■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WWV3 80 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NPTXRO95502 500 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 WEE2P0C1S8 567 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 CYP11B2P19099 503 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF174Q15697 407 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 APOL6Q9BWW8 343 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PLXNA3P51805 1871 aa23.22■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PAPLNO95428 1278 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 AKAP5P24588 427 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NAMPTP43490 491 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 KANK3Q6NY19 840 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 PADI6Q6TGC4 694 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 CYP26C1Q6V0L0 522 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 STK24Q9Y6E0 443 aa23.21■■□□□ 1.31
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF35A5YM69 484 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 N4BP3O15049 544 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 TEX28O15482 410 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R5AQ15172 486 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK6Q16659 721 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS33Q8NF86 280 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PIEZO1Q92508 2521 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD2LO14523 706 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN5P54829 565 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PDIA5Q14554 519 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 FUT10Q6P4F1 479 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 BSNDQ8WZ55 320 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 FNIP2Q9P278 1114 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.19■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 F8W810 466 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ACKR2O00590 384 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 BRD1O95696 1058 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 GLUD1P00367 558 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 NUBP1P53384 320 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 CREMQ03060 361 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 USP41Q3LFD5 358 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf34Q49A92 452 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 IER5LQ5T953 404 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PARP2Q9UGN5 583 aa23.18■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 LAD1O00515 517 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PRKCBP05771 671 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 EFNA5P52803 228 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 TUSC3Q13454 348 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 KIFAP3Q92845 792 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 RAB34Q9BZG1 259 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 KLK14Q9P0G3 267 aa23.17■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 96.8
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