RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 EXTL3O43909 919 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 ACTN1P12814 892 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 SLC9A1P19634 815 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 FMO5P49326 533 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CYP24A1Q07973 514 aa21.93■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF410Q86VK4 478 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.93■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.93■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 LRRN2O75325 713 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 GNAT1P11488 350 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PROZP22891 400 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 GCLMP48507 274 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TSPAN1O60635 241 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 NOL4O94818 638 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 FAM187BQ17R55 369 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 TMEM139Q8IV31 216 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CEP120Q8N960 986 aa21.92■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.92■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.91■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.91■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.91■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.91■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 ZNF233A6NK53 670 aa21.9■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 SKILP12757 684 aa21.9■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 KRT9P35527 623 aa21.9■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 ITGA7Q13683 1181 aa21.9■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.9■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.9■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 PTPRJQ12913 1337 aa21.9■■□□□ 1.1
ODC1-202ENST00000405333 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.11e-6■■□□□ 13
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ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.9■■□□□ 1.1
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ODC1-202ENST00000405333 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.89■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
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ODC1-202ENST00000405333 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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ODC1-202ENST00000405333 GBP6Q6ZN66 633 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 CNGA4Q8IV77 575 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ZNF516Q92618 1163 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 NUP58Q9BVL2 599 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 GANQ9H2C0 597 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ANK1P16157 1881 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 ESPNB1AK53 854 aa21.87■■□□□ 1.09
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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