RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361368.6

SMURF1-202, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-202ENST00000361368 LDHDQ86WU2 507 aa21.5■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.5■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 DFFAO00273 331 aa21.5■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 ABCB6Q9NP58 842 aa21.5■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 E2F5Q15329 346 aa21.5■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.49■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.49■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 CFAP69A5D8W1 941 aa21.49■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 HIST1H2ADP20671 130 aa21.49■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 PID1Q7Z2X4 250 aa21.48■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 SLC44A5Q8NCS7 719 aa21.48■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.48■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 CYTH2Q99418 400 aa21.48■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 SENP1Q9P0U3 644 aa21.48■■□□□ 1.03
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SMURF1-202ENST00000361368 TYK2P29597 1187 aa21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 CEP55Q53EZ4 464 aa21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 HIPK4Q8NE63 616 aa21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SMURF1-202ENST00000361368 SNAPC2Q13487 334 aa21.47■■□□□ 1.03
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