RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MKNK1Q9BUB5 465 aa17.36■□□□□ 0.37
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SH3BP4-201ENST00000344528 FIS1Q9Y3D6 152 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 NCK2O43639 380 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MOXD1Q6UVY6 613 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR91A4D1P6 747 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBP10242 640 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
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