RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GJA10Q969M2 543 aa24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMC4P43686 418 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP4X1Q8N118 509 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AZIN2Q96A70 460 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ITIH2P19823 946 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MARK3P27448 753 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPN4P29074 926 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCN2Q14257 317 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGS9BPQ6ZS82 235 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MORC4Q8TE76 937 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WNT8AQ9H1J5 351 aa24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNJ1P48048 391 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GIT2Q14161 759 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GATA6Q92908 595 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLCO2A1Q92959 643 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAGEA13PA6NCF6 341 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMAPO00193 183 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CDH16O75309 829 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PYGMP11217 842 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR4P57081 412 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SFR1Q86XK3 245 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPR88Q9GZN0 384 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRC19Q9H756 370 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa24.27■■□□□ 1.48
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASTN1O14525 1302 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP9AO75110 1047 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TJP3O95049 919 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHKAP35790 457 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CACNA2D1P54289 1103 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KYNUQ16719 465 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTPRN2Q92932 1015 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PDP2Q9P2J9 529 aa24.26■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM47DPA6NHR8 397 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RANBP1P43487 201 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THAP12O43422 761 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ASMTLO95671 621 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COMTP21964 271 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNA3P22001 575 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PALB2Q86YC2 1186 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EYA3Q99504 573 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EURLQ9NYK6 297 aa24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLRK1P26718 216 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC6Q16204 474 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C10orf82Q8WW14 230 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NRG4Q8WWG1 115 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCSTNQ92542 709 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAR1AQ9NR31 198 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBK1Q9UHD2 729 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CBX6O95503 412 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CETPP11597 493 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KIF22Q14807 665 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARMC3Q5W041 872 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGPAT1Q99943 283 aa24.24■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP17L5A8MUK1 530 aa24.23■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MED24O75448 989 aa24.23■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLK2P49760 499 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GPC5P78333 572 aa24.23■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CAV1Q03135 178 aa24.23■■□□□ 1.47
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KRT17Q04695 432 aa24.23■■□□□ 1.47
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