RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000211953.1

Lncbate1-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lncbate1, Length 812 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Igdcc4Q9EQS9 1252 aa7.67□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cnga3Q9JJZ8 631 aa7.67□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Klra17Q9JMA4 273 aa7.67□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lama3Q61789 3330 aa7.67□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Wfdc16A2A5H4 111 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm28042B7ZCM9 1014 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm10110D3Z5M2 615 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tnfrsf18O35714 228 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Apba3O88888 571 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hoxc8P09025 242 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 ZfxP17012 799 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rbp3P49194 1234 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gng11P61953 73 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PrkcbP68404 671 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Asprv1Q09PK2 339 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf113a2Q14B01 337 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lrig2Q52KR2 1054 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Krt15Q61414 452 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sorbs1Q62417 1290 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 RetsatQ64FW2 609 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cep70Q6IQY5 616 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sestd1Q80UK0 696 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pi4kbQ8BKC8 816 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Hgh1Q8C3I8 393 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 OgtQ8CGY8 1046 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf208Q8K0W3 265 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Iqsec1Q8R0S2 961 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 TraipQ8VIG6 470 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp6v0a4Q920R6 833 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem39aQ9CYC3 486 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Polr3eQ9CZT4 710 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Lysmd1Q9D0E3 226 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Desi2Q9D291 194 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pold3Q9EQ28 462 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pdcd7Q9WTY1 482 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Slc26a3Q9WVC8 757 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem131O70472 1877 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mia3Q8BI84 1930 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plxnb3Q9QY40 1902 aa7.66□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cntnap3E9PY62 1287 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 LctF8VPT3 1931 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Kng1O08677 661 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sema4dO09126 861 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Trim30aP15533 496 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gjb1P28230 283 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Map2k1P31938 393 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cyp2f2P33267 491 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gjb6P70689 261 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Drp2Q05AA6 957 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nhej1Q3KNJ2 295 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Zfp957Q3UT76 567 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tmem232Q5K6N0 675 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Samhd1Q60710 627 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dlg4Q62108 724 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sin3bQ62141 1098 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Srd5a1Q68FF9 255 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cdc14aQ6GQT0 603 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Mbtd1Q6P5G3 631 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Frmd5Q6P5H6 517 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Papd7Q6PB75 542 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 IqceQ6PCQ0 778 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Dmtf1Q8CE22 761 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Frat2Q8K025 231 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Vopp1Q8R1C3 172 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Pcdha9Q91Y11 979 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Me2Q99KE1 589 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tlr3Q99MB1 905 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Retreg3Q9CQV4 466 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Castor1Q9CWQ8 331 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Adgrf4Q9D2L6 698 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Fam111aQ9D2L9 613 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ubxn11Q9D572 484 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Drap1Q9D6N5 205 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 1700016D06RikQ9DAA5 166 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Elf2Q9JHC9 593 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Sv2aQ9JIS5 742 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PigoQ9JJI6 1093 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nudt5Q9JKX6 218 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Cpsf3Q9QXK7 684 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Rnf103Q9R1W3 683 aa7.65□□□□□ -1.18
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ankrd16A2AS55 361 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 PotegA5H0M4 473 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Krt28A6BLY7 462 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Olfr456B2RT27 312 aa7.64□□□□□ -1.19
Lncbate1-201ENSMUST00000211953 Ttc17E9PVB5 1198 aa7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 164.4 ms