RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044163.9

Cnot4-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnot4, Length 3,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Unc5bQ8K1S3 945 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Spire2Q8K1S6 718 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Znf445Q8R2V3 986 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Atp6v0a4Q920R6 833 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rbm31yQ9D3U4 565 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rbp7Q9EPC5 134 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Usp29Q9ES63 869 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Adam22Q9R1V6 904 aa6.7□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zswim8Q3UHH1 1832 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gcnt4E9Q649 455 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pagr1bF6V0H0 108 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Samd15F6XZJ7 620 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zfp457L7N1X4 647 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Flot1O08917 428 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ncf2O70145 525 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mgat1P27808 447 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Atp8a1P70704 1164 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Sox10Q04888 466 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cyp2c67Q569X9 491 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ugt1a9Q62452 528 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pde1cQ64338 706 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 B4galnt4Q766D5 1034 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Kctd6Q8BNL5 237 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 E330017A01RikQ8BU47 192 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Dhx32Q8BZS9 744 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pagr1aQ99L02 253 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 RpainQ9CWY9 219 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Q9CYI0 393 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ankef1Q9D2J7 775 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ccdc91Q9D8L5 442 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ccdc88cQ6VGS5 2009 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Syngap1F6SEU4 1340 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 DgkkE9Q7N4 1118 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Prdm15E9Q8T2 1174 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Vmn2r15L7N2A0 855 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Akr1b8P45377 316 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pon1P52430 355 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rhox5P52651 210 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pkn1P70268 946 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Frg1P97376 258 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 AarsQ8BGQ7 968 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Gcfc2Q8BKT3 769 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Senp7Q8BUH8 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Calhm6Q8C9E8 313 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Klhl11Q8CE33 709 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 BlmhQ8R016 455 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tsnaxip1Q99P25 704 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mipol1Q9D9F8 279 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 AvenQ9D9K3 342 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rtn3Q9ES97 964 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Sv2aQ9JIS5 742 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Sucla2Q9Z2I9 463 aa6.69□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Col4a3Q9QZS0 1669 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Hsf3D0VYS2 492 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Myo1eE9Q634 1107 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Wfs1P56695 890 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Tspyl3Q3UYP3 334 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Arhgap44Q5SSM3 814 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rnf187Q8BFX1 236 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Cnot10Q8BH15 744 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rassf10Q8BL43 508 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rccd1Q8BTU7 377 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 BbxQ8VBW5 907 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pcdha2Q91Y17 948 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ino80bQ99PT3 375 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Snx24Q9CRB0 169 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Zfp623Q9CY99 499 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Nudt12Q9DCN1 462 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Sbf2E9PXF8 1872 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Fbf1A2A870 1173 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Bpifb9bA2AJD1 591 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pla2g6P97819 807 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Neurl1bQ0MW30 546 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Q3UTZ3 580 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Vil1Q62468 827 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Bpifb9aQ80XI7 591 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rassf2Q8BMS9 326 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 AsphQ8BSY0 741 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Pkn2Q8BWW9 983 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Epc2Q8C0I4 808 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Apol9bQ8C7I4 310 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 DnerQ8JZM4 737 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Apol9aQ8VDU3 310 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 BrdtQ91Y44 956 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Dhx58Q99J87 678 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Rnf14Q9JI90 485 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Prmt2Q9R144 448 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Clca3bE9PUL3 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Trappc3O55013 180 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 PtpraP18052 829 aa6.68□□□□□ -1.34
Cnot4-201ENSMUST00000044163 Bcat1P24288 386 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms